BEGIN
DECLARE i INT DEFAULT 0;
WHILE i<1000
DO
  INSERT INTO author(name, email) VALUES("name", CONCAT("email@",i));
SET i=i+1;
END WHILE ;
END

CREATE TABLE IF NOT EXISTS `author` (
  `id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,
  `name` varchar(255) DEFAULT NULL,
  `email` varchar(255) DEFAULT NULL
) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=11512 DEFAULT CHARSET=utf8;

你的innodb_flush_log_at_commit值是多少？ sync_binlog值是多少？
可以将innodb_flush_log_at_commit设置成为0，将sync_binlog设置成0，你再试试看效果怎样？

你加上了 这个 WHERE id >= 0 肯定是不会有结果的，原因是你的表示空的一条记录也没有，所以加上 WHERE id >= 0 也还是0条记录，怎么insert都是空的。
本人刚才试了一下，只要0.26秒，你看看 autocommit能否为off，假如是，那就改成on：

mysql> use world;
Database changed
mysql> CREATE TABLE IF NOT EXISTS `author` (  `id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,  `name` varchar(255) DEFAULT NULL,  `email` varchar(255) DEFAULT NULL) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=11512 DEFAULT CHARSET=utf8;
Query OK, 0 rows affected (0.99 sec)
mysql> delimiter $$
mysql> CREATE  PROCEDURE `author_copy_self`(IN `nThousnd` INT)
    ->     NO SQL
    -> BEGIN
    ->
    -> DECLARE i INT DEFAULT 0;
    -> SET i = 0;
    -> WHILE i < nThousnd
    -> DO
    ->   INSERT INTO
    ->   author(name,email)
    ->     SELECT name,email
    ->     FROM author
    ->     WHERE id >= 0 LIMIT 1000;
    -> SET i = i + 1;
    -> END WHILE ;
    ->
    -> END$$
Query OK, 0 rows affected (0.12 sec)
mysql> show variables like "autocommit%"$$
+--+--+
| Variable_name | Value |
+--+--+
| autocommit    | ON    |
+--+--+
1 row in set (0.09 sec)
mysql> call author_copy_self(1000)$$
Query OK, 0 rows affected, 2 warnings (0.26 sec)
mysql> delimiter ;
mysql> select * from author;
Empty set (0.01 sec)

对于插入数据影响最大的是插入缓存。
正常缓存 1000条的插入应该在1s内，
试试开头加 SET AUTOCOMMIT=0，结束加commit看看

自动commit每次都会写redo，真正耗时的不是插入，而且每次写redo。
innodb_log_file_size 一般在1g