我没实际做过，但理论上应该是这样的
点击上传按钮之后，一个线程在执行上传操作；另一个线程要监测已上传的文件部分的大小（假如原100M文件，上传了20M的时候，进度为20%），并实时的返回页面。
看样子不太好实现，你还是在网上找找现成的控件吧。

另，ajax的是可以向服务器发送请求的时候，后续的执行其他东西的，如：

function test(){
    ajax()....;  //向服务器发送请求中，被断点暂停，此时下面的弹框执行了
    alert("我执行了！");
}

不用开线程啊，你写两个servlet。一个是处理上传文件的，读取文件，把进度存放到session中，另一个servlet就从session中获取进度信息。前台2个ajax请求，一个上传，另一个定时获取进度就行了。
用现成的控件也行，jquery fileupload

atitit.文件上传带进度条的实现原理and组件选型and最佳实践总结O7 – attilax的专栏 – 博客频道 – CSDN.NET.htm