发现很多人都担心本人的.net程序被破解，用混淆工具也不安全，有各种大杀器可以反混淆，而且很多混淆工具都是收费的，所以一直想本人动手实现，后来发现了一篇文章提供的方法非常好，但本人发现很多人并不知道，而且文章也很久远了，不支持现在的.net 4.0以上版本和64bit，所以本人做了些修改，并在这里推广下，希望广大.net开发者都能够掌握这套方法
首先，感谢原作者，原文地址：http://www.cnblogs.com/northstarlight/archive/2010/07/04/1771021.html
第二，由于原帖中原理已经讲得非常透彻了，本人在这里就概括下，想详细了解原理的请看原帖
原理概述：
我们都知道，C#会编译成IL，我们只要修改了IL，例如胡乱填写一些指令或修改为nop指令即可达到加密的作用，最终只要在运行时再修改回来即可正常运行。C#的函数最终运行是要编译成native code的，在clrjit中有一个函数compileMethod就是干这个事的，要把IL转换为native code，首先要做的就是找到IL指令地址，我们hook该函数控制其执行流程，修改IL指令地址为加密函数的真实IL指令地址，这样就可以完美加密运行了，即：
加密函数（假IL）->动态替换真实IL->编译->还原假IL（防止内存dump）->运行
本人写的例子：https://github.com/bigbaldy1128/EncryptMethodTest.git
修改原始IL指令（本人用的dnspy）

保存原始IL

BYTE testFunCode[0x9] =
{
	0x00,
	0x03,
	0x04,
	0x58,
	0x0A,
	0x2B,0x00,
	0x06,
	0x2A
};

hook compileMethod还原真实IL

int __stdcall my_compileMethod(ULONG_PTR classthis, ICorJitInfo *comp,
							   CORINFO_METHOD_INFO *info, unsigned flags,         
							   BYTE **nativeEntry, ULONG  *nativeSizeOfCode)
{
   const char *szMethodName = NULL;
   const char *szClassName = NULL;
   szMethodName = comp->getMethodName(info->ftn, &szClassName);
   BYTE* old = info->ILCode;
    if (strcmp(szMethodName, "Test") == 0)
	{
		info->ILCode= testFunCode;
	}
	int nRet = compileMethod(classthis, comp, info, flags, nativeEntry, nativeSizeOfCode);
	info->ILCode = old;
	return nRet;
}

这种加密方式的好处：
1.针对函数指令加密，任何反混淆工具都将失效
2.原函数指令在C++写的dll中，逆向难度较大
3.C++的dll可以采用原生的各种强加密方式，例如TMD或VM壳，一般是破解不了的
4.原函数指令只有在编译的那一瞬间存在于内存，所以就算用Megadumper这种强力的内存导出工具也是没用的
5.使用超级简单，只需随意填充要加密的函数，并复制原指令到C++的dll中即可