修改如下：

int main()
{
	int n, i, s;
	for (n = 2; n <= 1000; n++)
	{
		s = 0;
		for (i = 1; i < n; i++)
		{
			if (n % i == 0)
				s = s + i;
		}
		if (s == n)
		{
			printf("%d是完全数。它的因子是：", n);
			for (i = 1; i < n; i++)
			{
				if (n % i == 0)
					printf("%d  ", i);
			}
			printf("\n");
		}
	}
	return 0;
}

一个高效点的版本：

int factors[100];  //存放因子
int main()
{
	int n, i, j, s;
	for (n = 2; n <= 1000; n++)
	{
		s = 0;
		j = 0;
		for (i = 1; i <= n/2; i++)
		{
			if (n % i == 0)
			{
				s = s + i;
				factors[j++] = i;  //记录n的因子
			}
		}
		if (s == n)
		{
			printf("%d是完全数。它的因子是：", n);
			for (i = 0; i < j; i++) printf("%d ", factors[i]);
			printf("\n");
		}
	}
	return 0;
}
//6是完全数。它的因子是：1 2 3
//28是完全数。它的因子是：1 2 4 7 14
//496是完全数。它的因子是：1 2 4 8 16 31 62 124 248

第二个for循环应该只包含紧跟它的if语句，你的目的是对穷举找出n的每个因子并求和。在你的源代码里，把第二个if也包含在内，就会在求n因子的过程中(还没有完全求完，只是部分因子)得到的和与n相同，然后就会输出全部。

多谢各位高手指点！